RHive的安装和用法
RHive 是一种通过HIVE高性能查询来扩展R计算能力的包。它可以在R环境中非常容易的调用HQL,也允许在Hive中使用R的对象和函数。理论上数据处理量可以无限扩展的Hive平台,搭配上数据挖掘的利器R环境,堪称是一个完美的大数据分析挖掘的工作环境。
1. 环境配置
(配置部分是同事搞定的,只记录一些细节)
RHive 依赖于Rserve,因此在安装R的时候有些变化:
./configure --disable-nls --enable-R-shlib
make
make install
enable-R-shlib
是将R作为动态库进行安装,这样像Rserve依赖于R动态库的包就可以安装了,但缺点是会有20%左右的性能下降
。
1.1. Rserve的安装
正常的安装R包:
install.packages('rJava')
install.packages('Rserve')
在安装Rsever用户下,创建一目录,并创建Rserv.conf文件,写入``remote enable''保存并退出。
通过scp -r 命令将Master节点上安装好的Rserve包,以及Rserv.conf文件拷贝到所有slave节点下,
scp -r /data2/soft/R2.15/library/Rserve slave1:/data2/soft/R2.15/library/
scp -r /data2/soft/R2.15/library/Rserve slave2:/data2/soft/R2.15/library/
scp -r /data2/soft/R2.15/library/Rserve slave3:/data2/soft/R2.15/library/
scp -r /data2/soft/Rserv.conf slave1:/data2/soft/
scp -r /data2/soft/Rserv.conf slave2:/data2/soft/
scp -r /data2/soft/Rserv.conf slave3:/data2/soft/
在所有节点启动Rserve
Rserve --RS-conf /data2/soft/Rserv.conf
telnet slave1 6311
在Master节点telnet所有slave节点,显示 Rsrv0103QAP1 则表示连接成功
1.2. RHive的安装
安装包,并在master节点和所有slave节点创建目录,并授读写权限
R CMD INSTALL RHive_0.0-7.tar.gz
cd /data2/soft/
mkdir -p rhive/data
在master节点和所有slave节点的hadoop用户下配置环境变量
vi .bash_profile
export RHIVE_DATA=/data2/soft/R/rhive/data
通过scp -r 命令将Master节点上安装好的RHive包拷贝到所有slave节点下,
scp -r /data2/soft/R2.15/library/RHive slave1:/data2/soft/R2.15/library/
scp -r /data2/soft/R2.15/library/RHive slave2:/data2/soft/R2.15/library/
scp -r /data2/soft/R2.15/library/RHive slave3:/data2/soft/R2.15/library/
查看hdfs文件系统下的jar包是否有读写权限
hadoop fs -ls /rhive/lib
最后,启动hive远程服务: rhive是通过thrift连接hiveserver的,需要要启动后台thrift服务,即:在hive客户端启动hive远程服务
nohup hive --service hiveserver &
完毕。
2. RHive的使用
2.1. rhive-api
从HIVE中获得表信息的函数,比如
- rhive.list.tables:获得表名列表,支持pattern参数(正则表达式),类似于HIVE的show table
- rhive.desc.table:表的描述,HIVE中的desc table
- rhive.exist.table:
2.2. RHive 简单应用
载入Rhive包,并连接HIVE,获取数据:
library(RHive)
rhive.connect(host = 'host_ip')
d <- rhive.query('select * from emp limit 1000')
class(d)
m <- rhive.block.sample(data_sku, percent = 0.0001, seed = 0)
rhive.close()
一般在系统中已经配置了host,因此可以直接rhive.connect()
进行连接,记得最后要有rhive.close()
操作。
通过HIVE查询语句,将HIVE中的目标数据加载至R环境下,返回的 d
是一个dataframe。
实际上,rhive.query
的实际用途有很多,一般HIVE操作都可以使用,比如变更scheme等操作:
rhive.query('use scheme1')
rhive.query('show tables')
rhive.query('drop table emp')
但需要注意的是,数据量较大的情况需要使用rhive.big.query
,并设置memlimit参数。
将R中的对象通过构建表的方式存储到HIVE中需要使用
rhive.write.table(dat, tablename = 'usertable', sep = ',')
而后使用join等HIVE语句获得相关建模数据。其实写到这儿,有需求的看官就应该明白了,这几项 RHive 的功能就足够 折腾些有趣的事情了。
注1:其他关于在HIVE中调用R函数,暂时还没有应用,未来更新。
注2:
rhive.block.sample
这个函数需要在HIVE 0.8版本以上才能执行。